ماموریت موسسه خدمات مدیریت سازمان حسابرسی ارائه خدمات طراحی و اجرای سیستمهای اطلاعات حسابداری است. موسسه بر اساس طرح راهبردی مصوب، هدفهای بلندمدت زیر را دنبال میکند:
واحد خدمات مدیریت پروژه های متعددی در زمینه طراحی نظامهای مالی و صنعتی مشتمل بر طراحی سیستمهای مالی،بهای تمام شده،هزینه یابی بر مبنای فعالیت،روشهای گردش عملیات خرید ،انبارداری،تولید و فروش،بودجه،گزارشهای مدیریت،سازمان و شرح مشاغل امور مالی،آئین نامه های مالی، خدمات مالی(اصلاح حساب)در واحدهای اقتصادی با رشته های صنعتی گوناگون انجام داده و تجربه گسترده ای در این زمینه دارد.
این واحد در سه سال اخیر در بخش صنایع مخابراتی، صنایع هواپیماسازی، بانکداری، عمران و بهسازی، سیمان، شهرکهای صنعتی، عمران شهرهای جدید، حمل ونقل ریلی، خدمات فرودگاهی و حمل و نقل دریایی حضوری فعال داشته است.